La galerie des portraits romains au 1er étage. © J.-F. PeiréDepuis le réaménagement du musée dans les années 1990, le rez-de-chaussée du bâtiment accueille les expositions temporaires.
Au premier étage sont présentées les collections de sculptures mises au jour dans la villa romaine de Chiragan.
Le deuxième étage évoque l’antique Tolosa et la région romaine de Narbonnaise
Enfin, le sous-sol présente l’archéologie funéraire romaine ainsi que les sarcophages et inscriptions des premiers chrétiens. C’est aussi au sous-sol que l’on peut découvrir les vestiges dégagés lors des fouilles réalisées au moment des travaux et qui font du musée Saint-Raymond un véritable musée de site.Le sous-sol du musée. © Mairie de Toulouse